引物产品使用方法
Oligo合成产品使用说明
尊敬的客户:
您好!
感谢您对我们的信任与支持!您在使用本公司的Oligo合成产品时请阅读以下说明。
(1) 我们提供的合成报告上的Oligo序列是该Oligo合成时,由合成仪控制电脑及时打印的,所合成的oligo序列与此序列完全一致,如果该序列与您提交给我们的序列不同,请您立即与我们联系。
(2) 我们所提供的Oligo是通过紫外分光光度计在260nm波长下来定量的,其摩尔消光系数是根据碱基组成和邻位效应计算所得。我们在合成报告单上提供了每条Oligo的分子量、OD数、以及每管OD的nmole和μg数等,其中DNA还提供Tm值、GC含量值等。在引物的标签上我们同时提供了每管引物的总nmole数。
此报告单上提供的Oligo分子量均按照精确算法进行计算,公布如下:
MWDNA=(#A×313.21)+(#G×329.21)+(#C×289.18)+(#T×304.20)+(#I×314.19)+(#U×290.17)+(Nmod×Wmod)-61.96
MWRNA=(#A×329.21)+(#G×345.21)+(#C×305.18)+(#U×306.20)+(Nmod×Wmod)-61.96
注:#代表对应碱基的个数;Nmod,Wmod分别为修饰基团的数目和分子量;兼并碱基的分子量为兼并碱基的分子量总和除以兼并数。
TM值计算公式:当长度≤20mer,Tm=4℃(G+C)+ 2℃(A+T);当长度>20mer,Tm=0.41(% of GC)-675/L+81.5
注:1、L:引物碱基数:% of GC :引物GC含量;% of GC = GC个数/引物总碱基数
2、TM值计算并不保证正确,只是为实验参数设置提供一个参考。
(3) 我们提供的Oligo合成产品经真空干燥呈薄膜状或粉末状附在离心管壁上,使用前请先离心再小心开启,以免丢失。如您需要将引物稀释到10 uM,需要加入该管引物的(总nmole数*100) μL的无菌水或者pH8.0的TE溶液,然后轻轻盖上管盖,震荡混匀使其充分溶解。为了防止Oligo降解,溶解后请于-20℃保存,并避免反复冻融。尤其需要注意的是,RNA极易被RNase降解,因此必须确保在溶解以及相关实验操作时在无RNase的环境下进行。凡Oligo使用一段时间后出现讲解的,均可能与您的保存方式和实验用水的质量相关,此类情况我公司不承担相关责任。
(4)我们提供的Oligo的5’端和3’端均为羟基,可直接用于PCR。如果需要标记磷酸基团,请在提交订单时在本公司订购单的5’端和3’端修饰栏的下拉框内选择Phosphate。如需其他的荧光标记和碱基修饰服务,也请在此下拉框中选择。
(5)荧光标记的产品,如FAM、HEX、TAMRA等标记的Oligo因为光敏感,需避光保存。
(6)对于DNA引物我们提供PAGE和HPLC纯化方式。
(7)引物合成是一种多步骤的化学反应,每一步的合成效率不可能达到100%,副产品不可以避免。在您PCR扩增克隆以后,建议挑取2-3个克隆进行测序。如您发现所有克隆都在引物区存在突变,请及时与我们联系,我们会为您免费重新合成一次。